Mission : Impossible – The Final Reckoning s’inscrit dans la continuité de Mission : Impossible – Dead Reckoning, sorti en 2023. Dans celui-ci, Tom Cruise, alias Ethan Hunt, le personnage emblématique de la franchise, devait combattre un nouvel ennemi particulièrement redoutable : une Intelligence Artificielle nommée « l’Entité ».

À l'autre bout de l'univers, un savant quelque peu dérangé a donné naissance à Stitch, la créature la plus intelligente et la plus destructrice qui ait jamais existé. Conscientes de son exceptionnel potentiel dévastateur, les autorités de sa planète s'apprêtent à l'arrêter, mais le petit monstre prend la poudre d'escampette à bord de son vaisseau spatial. Il échoue sur Terre, en plein Pacifique, sur l'île d'Hawaii. Le petit alien est bientôt recueilli par Lilo, une adorable petite Hawaiienne de six ans qui le prend pour un chien abandonné. Celle-ci, élevée tant bien que mal par sa grande soeur Nani depuis la disparition de leurs parents, croit enfin avoir trouvé le compagnon de jeu et l'ami qu'elle espérait.

Dans la nuit, Nadira fuit Dehli après avoir poignardé un policier. Elle se cache dans une communauté de prostituées du nord de l’Inde où elle rencontre Devika, une jeune fille que sa mère veut marier de force.

Ensemble, au péril de leur vie, elles décident de se rebeller contre l’institution religieuse et les traditions archaïques pour conquérir leur liberté.